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Steckbrief des Fachgebietes Biologische Chemie
- © AG Süssmuth
| Fachgebiet: | |
| Biologische Chemie | |
| Leitung: | |
| Prof. R.D. Süssmuth | |
| Homepage: | |
| www.biochemie.tu-berlin.de | |
| Forschungsschwerpunkte: | |
| Wirkstofffindung und -entwicklung von Peptiden/Petidantibiotika für medizinalchemische Anwendungen. Weitere Schwerpunkte sind die Untersuchung von Biosynthesen ribosomal und nicht-ribosomal synthetisierter peptidischer Naturstoffe, Peptidengineering und kombinatorische Biosynthese. | |
| Arbeitstechniken: | |
| Proteinbiochemie: Genexpression, Proteinreinigung und ‑isolierung, Enzymkinetik, Proteomics, Pull-down-assays Molekularbiologie: Cosmid-Genbänke, Sondenscreening, PCR, Kloniertechniken, site-directed mutagenesis, combinatorial biosynthesis, gene knock-out Biologische Chemie: Peptidsynthese, Enzymsubstratsynthese, Inhibitordesign, ‑synthese und -screening, Mutasynthese, Precursor-directed biosynthesis Bioanalytik: Massenspektrometrie (ESI-QTOF/‑Qtrap/Orbitrap/FT-ICR, nano-ESI, imaging-MALDI-TOF), HPLC (mikroLS)-Kopplungstechniken, GC-MS, Aminosäuren- und Fettsäurenanalytik, CD-Spektroskopie, präparative HPLC, Chromatographie (Größenausschluss-, Ionenaustausch-, Affinitätschromatographie), NMR, Röntgenstrukturanalyse Schlüsselbegriffe: Genexpressionssysteme, Proteomics, Strukturbiologie, Massenspektrometrie, Bioengineering, Synthetische Biologie | |
| Publikationen: | |
| >160 Publikationen, 10 Reviews und 6 Patente 1. Cociancich et al., The gyrase inhibitor albicidin consists of p-aminobenzoic acids and cyanoalanine. Nat. Chem. Biol., 2015, 11(3):195-197 2. Jungmann et al., Dissecting reactions of nonlinear precursor peptide processing of the class III lanthipeptide curvopeptin. J. Am. Chem. Soc., 2014, 136, 15222-15228 3. Völler et al., Involvement and unusual substrate specifity of a prolyloligopeptidase in class III lanthipeptide maturation. J. Am. Chem. Soc., 2013, 135, 7426-7429 4. Kretz et al., TotalSynthesis of Albicidin: A Lead Structure from Xanthomonas albilineans for Potent Antibacterial Gyrase Inhibitors. Angew Chem Int Ed Engl., 2015, 54(6):1969-73 5. Müller et al., Paenilamicin-structure and biosynthesis of a hybrid non-ribosomal peptide/polyketide antibiotic from the bee pathogen Paenibacillus larvae. Angew. Chem. Int. Ed., 2014, 53, 10821-10825 | |
| Alumni: | |
| 40 former PhD students mostly in industry: Agilent Technologies, Almac (Belfast, Ireland), Aristo Pharma GmbH (Berlin), Bachem (Basel, Switzerland), BASF (Mannheim), Boehringer Ingelheim Pharma (Biberach), Dr. Knoell Consult GmbH (Mannheim), JPT Peptide Technologies GmbH (Berlin), Merz Pharmaceuticals (Frankfurt a. M.), Metanomics (Berlin), Novartis (Basel, Switzerland), Parexel (Berlin), Roche (Basel, Switzerland), Sandoz GmbH (Kundl, Austria), Siemens AG (Berlin), Sigma-Aldrich (Buchs, Switzerland) | |
| Industriekollaborationen: | |
| Bayer AG, Boehringer-Ingelheim GmbH, EVONIK, Pentracor, CORDEN Pharma, Siemens AG, Sanofi | |
| Wissenschaftliche Zusammenarbeit: | |
| Prof. Hermen Overkleeft, (Universität Leiden, NL), Prof. Renier van der Hoorn (Oxford University, UK), Prof. Dr. Ashraf Brik (Technion, Haifa, IL), Prof. Dr. Peter Leadlay (Cambridge University, UK), Dr. Elke Genersch (Freie Universität, Berlin) | |
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