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TU Berlin

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Steckbrief des Fachgebietes Bioanalytik

Bioanalytik
Lupe
Fachgebiet:
Bioanalytik
Leitung:
Prof. J. Rappsilber
Homepage:
www.bioanalytik.tu-berlin.de
Forschungsschwerpunkte:
Dr. Juri Rappsilber erforscht die Interaktionen von Proteinen und ihrer Strukturen mittels neuer Methoden, die die Gruppe selbst entwickelt.
Arbeitstechniken  (Schlüsselbegriffe):
Methoden der organischen Chemie, Proteinbiochemie, Molekularbiologie und Zellbiologie (humane Zellkultur) mit Schwerpunkt auf Bioanalytik: Massenspektrometrie und Bioinformatik (Proteomics)
Publikationen:
>100 Publikationen (h-index 45)
1. Barysz H et al. Three-dimensional topology of the SMC2/SMC4 subcomplex from chicken condensin I revealed by cross-linking and molecular modelling. Open Biol. 2015 Feb;5(2):150005.
2. Combe et al. xiNET: cross-link network maps with residue resolution. Mol Cell Proteomics. 2015, 14:1137-47.
3. Kustatscher et al. Chromatin enrichment for proteomics. Nat Protoc. 2014, 9:2090-9.
4. Alabert C et al. Nascent chromatin capture proteomics determines chromatin dynamics during DNA replication and identifies unknown fork components. Nat Cell Biol. 2014, 16:281-93.
5. Kustatscher G et al. Proteomics of a fuzzy organelle: interphase chromatin. EMBO J. 2014, 33:648-64
Alumni:
3 former PhD students: University of Edinburgh, Roche, Radboud University Nijmegen
Industriekollaborationen:
Quiagen
Wissenschaftliche Zusammenarbeit:
TU Berlin: Roland Lauster, Ned Budisa, Oliver Brock; FMP Berlin: Phil Selenko; Charité: Christian Spahn, Peter Hildebrand, Elke Beate Krüger; MDC Berlin: Thomas Sommer, Oliver Daumke, Andreas Herrmann; FU Berlin: Markus Wahl; MPI mol Genetik: Thorsten Mielke; EBI Hinxton UK: Henning Hermjakob; University of Bristol: Imre Berger, Christiane Berger-Schaffitzel; University of Birmingham: Melissa Grant; University of Sussex: Helfrid Hochegger; Brunel University London: Paola Vagnarelli; University College London: Finn Werner; Imperial College: Christian Speck, Sivaramesh Wigneshweraraj; Wellcome Trust Centre for Cell Biology, SBS, University of Edinburgh: Adrian Bird, Adele Marston, Patrick Heun, David Tollervey, Bill Earnshaw, Robin Allshire, Arockia J. Arulanandam, Jean D Beggs, Atlanta G. Cook, Kevin G. Hardwick, Gracjan P. Michlewski, Hiroyuki Ohkura, Kenneth E. Sawin, Eric Schirmer, Irina Stancheva, Philipp Voigt, Malcolm Walkinshaw, Julie Welburn; Institute of Structural and Molecular Biology, SBS, University of Edinburgh: Manfred Auer, Paul Barlow, Jon Marles-Wright, Sander Granneman, Julia Richardson;  Institute of Cell Biology, SBS, University of Edinburgh: Yizhi Cai, Elizabeth Bayne; Institute of Immunology and Infection Research, SBS, University of Edinburgh: Keith R. Matthews;  Institute of Stem Cell Research, SBS, University of Edinburgh: Ian Chambers, Donal O'Carroll, Soufi Abdenour; Institute of Molecular Plant Sciences, SBS, University of Edinburgh: Justin Goodrich; Centre for Neuroregeneration, College for Medicine and Veterinary Medicine, University of Edinburgh: Peter J. Brophy, Dies Meijer

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